Meskipun Skuadron Spearhead telah menghilang di balik cakrawala, propaganda tanpa henti Republik San Magnolia tak berhenti. Vladilena Milizé tetap beroperasi sebagai “Handler One,” komandan skuadron faksi ke-86 yang didesimilisasi dalam perang berkelanjutan melawan Legion.
Di Front Barat, Shinei Nouzen dan pasukannya dikarantina di pangkalan militer yang dikendalikan oleh Republik Federal Giad, yang dulunya dikenal sebagai Kekaisaran Giadian. Pemerintah yang baru berdiri ini memberikan kewarganegaraan penuh dan kebebasan kepada para Eighty-Six yang selamat. Ditempatkan di kediaman presiden Ernst Zimmerman sendiri, kelompok itu bertemu dengan putri angkatnya dan Kaisar terakhir, Augusta Frederica Adel-Adler.
Namun, di tengah ketenangan masyarakat yang lembut ini, Shinei dan timnya merasa bahwa tujuan mereka ada di medan perang. Tak lama kemudian, mereka kembali berada di tengah serangan Legion sebagai bagian dari Skuadron Nordlicht Federasi, ditemani oleh Augusta Frederica. Namun, seiring sejarah terulang, mereka menyadari bahwa tidak peduli pihak mana, kematian dan rasa sakit di garis depan adalah satu-satunya kenyamanan yang mereka kenal.
