Berbeda dengan saudara kembarnya, Yukio, Rin Okumura tidak pernah ingin tahu tentang orang tua mereka dan keadaan seputar kelahirannya. Namun, master waktu, Mephisto Pheles, memberi Rin sebuah kunci yang membawanya 40 tahun ke masa lalu, saat mendiang ibunya, Yuri Frederick Egin, masih seorang anak-anak. Dengan bimbingan Mephisto, Rin melompati tahun-tahun masa kecil Yuri dan masa remajanya sebagai exorcist-in-training.
Sejak awal, Yuri bertemu Shirou Fujimoto, ayah angkat Rin dan Yukio. Saat Rin mengikuti kehidupan Yuri dan Shirou, ia menyaksikan langsung kemunculan awal Satan, ayah kandungnya, dan kengerian yang terjadi di Seksi 13 khusus True Cross Order. Hubungan unik Yuri dengan Satan akhirnya membawa Rin pada kebenaran di balik peristiwa paling mengerikan dalam sejarah exorcist dan hari di mana ia dan Yukio lahir—yaitu Blue Night.
