Lima puluh tahun yang lalu, makhluk misterius yang dikenal sebagai “Huge” tiba-tiba muncul di seluruh dunia, menimbulkan ancaman eksistensial bagi umat manusia. Untuk bertahan melawan ancaman ini, para prajurit wanita remaja yang dikenal sebagai “Lilies” menggunakan energi “Magie” di dalam tubuh mereka untuk menggerakkan senjata yang disebut “Counter Huge ARMS” atau “CHARMS.”
Setelah diselamatkan oleh seorang Lily dua tahun lalu saat evakuasi dari serangan Huge, Riri Hitotsuyanagi bersumpah untuk menjadi Lily sendiri. Ia mendaftar di akademi bergengsi Yurigaoka, tempat pelatihan bagi para Lily, dan menemukan bahwa salah satu teman sekelasnya adalah Yuyu Shirai—Lily yang sama yang menyelamatkannya. Namun, yang membingungkan Riri, orang yang ia kira ceria ternyata cukup antisosial dan lebih suka bertarung sendirian. Meskipun begitu, Riri tetap berkeinginan untuk akrab dengan Yuyu dan bersedia melakukan apa pun untuk mencapai tujuan itu.
Bersama Yuyu dan Lilies lainnya di sisinya, perjalanan Riri untuk menjadi salah satu dari mereka baru saja dimulai!
