Yoichi Isagi hanya tinggal selangkah lagi mencetak gol yang akan membawa tim sepak bola SMA-nya ke tingkat nasional. Namun, keputusan sepersekian detik untuk mengumpan bola ke rekan setimnya merenggut kenyataan itu darinya. Merasa pahit, bingung, dan kecewa, Isagi bertanya-tanya apakah hasilnya akan berbeda jika ia tidak mengumpan bola.
Ketika striker muda itu kembali ke rumah, sebuah undangan dari Federasi Sepak Bola Jepang menantinya. Melalui proses pengambilan keputusan yang sewenang-wenang dan bias, Isagi adalah satu dari tiga ratus striker U-18 yang terpilih untuk proyek kontroversial bernama Blue Lock.
Tujuan utama proyek ini adalah mengubah salah satu pemain terpilih menjadi striker bintang untuk tim nasional Jepang. Untuk menemukan peserta terbaik, setiap “berlian mentah” harus bersaing dengan yang lain melalui serangkaian kompetisi individu dan tim untuk mencapai puncak. Mengesampingkan keberatan etisnya terhadap proyek tersebut, Isagi merasa terdorong untuk berjuang menuju puncak, bahkan jika itu berarti dengan kejam menghancurkan impian 299 striker muda lainnya.