Pada tahun 2010, Kekaisaran Suci Britannia memantapkan dirinya sebagai negara militer dominan, dimulai dengan penaklukan Jepang. Jepang, yang berganti nama menjadi Area 11 setelah kekalahan cepatnya, telah menunjukkan perlawanan signifikan terhadap tirani ini dalam upaya mendapatkan kembali kemerdekaan.
Lelouch Lamperouge, seorang siswa Britannia, sayangnya terjebak dalam baku tembak antara pasukan bersenjata Britannia dan pemberontak Area 11. Namun, ia berhasil melarikan diri berkat kemunculan tepat waktu seorang gadis misterius bernama C.C., yang menganugerahinya Geass, “Kekuatan Raja-raja.” Menyadari potensi besar dari “kekuatan kepatuhan absolut” yang baru ia peroleh, Lelouch memulai perjalanan berbahaya sebagai vigilante bertopeng yang dikenal sebagai Zero, memimpin serangan tanpa ampun terhadap Britannia untuk membalas dendam sekali dan untuk selamanya.