Ayumu Aikawa adalah seorang siswa SMA berusia 16 tahun yang tewas secara tragis saat sedang menyelidiki sebuah rumah mencurigakan. Namun, ia tiba-tiba terbangun di samping seorang gadis misterius berzirah bernama Eucliwood Hellscythe. Eucliwood mengaku sebagai seorang necromancer (ahli sihir kebangkitan) yang telah menghidupkan kembali Ayumu—dan menjadikannya seorang zombie!
Kini abadi, Ayumu pun memulai pencarian untuk menemukan siapa pembunuhnya. Suatu hari, saat mencari petunjuk di pemakaman, ia bertemu dengan seorang gadis energik bernama Haruna yang sedang bertarung melawan seekor beruang raksasa dengan gergaji mesin—dalam kostum gadis sihir! Setelah berhasil mengalahkan monster tersebut, Haruna mencoba menghapus ingatan Ayumu. Namun, secara tak sengaja, Ayumu malah menyerap kekuatan sihir milik Haruna.
Kini tanpa kekuatan, Haruna memaksa Ayumu untuk mengambil alih tugasnya sebagai “Magical Garment Girl” dan melawan makhluk aneh bernama Megalo—monster yang mengganggu dunia manusia.
Kore wa Zombie Desu ka? menghadirkan kisah penuh aksi, komedi, dan kekacauan supernatural, mengikuti keseharian Ayumu yang kini harus menjalani kehidupan baru sebagai zombie dengan tugas-tugas kocak dan berbahaya di dunia yang tidak lagi normal.
