The Abyss—sebuah jurang menganga yang membentang jauh ke kedalaman bumi, dipenuhi makhluk misterius dan relik dari masa lalu. Bagaimana ia terbentuk? Apa yang ada di dasarnya? Banyak individu pemberani, yang dikenal sebagai Divers, telah berusaha memecahkan misteri Abyss, dengan berani menuruni alamnya yang paling gelap. Yang terbaik dan paling berani dari para Divers, para White Whistles, dipuji sebagai legenda oleh mereka yang tetap di permukaan.
Riko, putri dari White Whistle yang hilang, Lyza the Annihilator, bercita-cita menjadi seperti ibunya dan menjelajahi kedalaman Abyss. Namun, sebagai Red Whistle yang masih pemula, ia hanya diizinkan menjelajahi lapisan teratas. Meski begitu, Riko secara kebetulan bertemu dengan robot misterius berwujud anak laki-laki biasa. Ia menamainya Reg, dan Reg tidak memiliki ingatan tentang peristiwa sebelum ia ditemukan. Yakin bahwa teknologi untuk menciptakan Reg pasti berasal dari kedalaman Abyss, keduanya memutuskan untuk melakukan perjalanan ke dalam jurang untuk memulihkan ingatannya dan melihat dasar lubang besar itu dengan mata kepala sendiri. Namun, mereka tidak mengetahui kenyataan pahit tentang keberadaan Abyss yang sebenarnya.
