Akademi Swasta Hachimitsu dikenal sebagai sekolah asrama elit khusus perempuan dengan aturan super ketat. Namun, sebuah perubahan besar terjadi ketika sekolah ini mulai menerima siswa laki-laki untuk pertama kalinya. Dari ratusan siswi, hanya lima anak laki-laki yang diterima: Kiyoshi, Gakuto, Shingo, Andre, dan Jo—dan mereka langsung menjadi minoritas yang tersingkir.
Terisolasi dan frustasi, mereka nekat merancang aksi gila: mengintip kamar mandi perempuan. Sayangnya, rencana mereka terbongkar oleh Dewan OSIS Bawah Tanah yang sadis. Hukuman mereka? Dimasukkan ke penjara sekolah dan harus bertahan hidup selama satu bulan penuh siksaan fisik dan mental.
Prison School adalah anime komedi dewasa yang penuh humor vulgar, situasi tak terduga, serta kisah persahabatan dan perjuangan absurd para siswa laki-laki dalam menghadapi sistem sekolah yang brutal. Cocok bagi penonton yang menyukai humor ekstrem dan satire sosial.