Pada suatu hari yang tenang, langit tiba-tiba terbelah dan makhluk ekstradimensional yang disebut sebagai Unknown menyerang umat manusia secara brutal dan mendadak. Untuk melindungi masa depan negara, seluruh anak-anak Jepang dibekukan secara kriogenik demi menjaga keselamatan mereka selama perang berlangsung.
Beberapa tahun kemudian, umat manusia berhasil membangun kembali wilayah pertahanan di sebagian Jepang. Saat bahaya kepunahan mulai mereda, anak-anak pun dibangkitkan dari tidur panjang mereka. Namun, dunia sudah berubah—selama proses kriogenik, mereka telah mengembangkan kekuatan supernatural yang disebut Worlds, unik bagi setiap individu.
Enam anak terkuat kini memimpin kota-kota yang telah direbut kembali. Ichiya Suzaku dan Canaria Utara menjaga Tokyo, Kasumi dan Asuha Chigusa memimpin Chiba, sedangkan Maihime Tenkawa dan Hotaru Rindou memimpin Kanagawa. Namun, perbedaan karakter dan ego tinggi menyebabkan konflik antar pemimpin kota.
Ketika serangan Unknown tiba-tiba menjadi lebih agresif, ketiga kota ini harus menyatukan kekuatan mereka. Jika gagal bekerja sama, garis pertahanan terakhir umat manusia bisa runtuh.
